Dear all,
We found something strange with our Galaxy instance...
Our Galaxy server is configured as a submit node using slurm to
submit to our cluster.
This works fine for the most part, but today we saw a samtools index job running "locally" on the submit node instead of a cluster node.
Is there any way of stopping this behavior? The submit nodes are not configured for data-intensive computation and everything runs significantly slower.
I was running bamtools (splitting a bam-file into mapped into
unmapped) at the time and the output bam-files were being
indexed.
Thanks and best regards,
Christopher
German Cancer Research Center (DKFZ)
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