Dear all,

I've been wanting to point this out for a while, but the latest update to the STAR data manager didn't fix it either (or maybe I messed up again).
The .loc file indicating which genomes have been installed/indices have been made for STAR uses the last column to indicate if there
is a gene model/annotation that it should use (0 - for no, 1 - for yes).
This seems to be empty...there is a tab at the end of the row,  but no number.
It works if you manually but in 1 or 0, but not that's not very convenient.

Please let me know if I'm missing something...

Cheers,
Christopher

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Dr. Christopher Previti
Genomics and
Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician

German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg
Germany
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www.dkfz.de

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