Dear Björn,

I just installed Salmon on our Galaxy instance and I have a couple of basic questions.

Currently the reference transcriptomes are put in the same data table as the genomes, would it be of interest to separate this and give the

transcriptomes their own table? I could probably try to do this...

There is a data manager available that unfortunately has a bug. We fixed that and it now populates the reference genome data table.

I would probably modify this as well use the new table. Could this be useful? I'm not sure how to proceed...would I give you the modified Salmon wrapper for inclusion in the package?

Best regards,

Christopher


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Dr. Christopher Previti
Genomics and
Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician

German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
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