Salut,
Merci Alban et Christophe,
Après acharnement et arrâchage de cheveux (que je n'ai pas d'ailleurs :) )
j'ai abandoné et j'ai opté pour ne plus utilisé le module xsendfile et ça marche à merveil, en tout cas pour l'instant. tous les symtômes décrits auparavant ont disparus.
Malheureusement je n'ai pas réussi à décerner où était le problème exactement, ce qui est sûr c'est que ça vient du module xsendfile.

bonne fin de journée à tous

2012/10/1 Christophe Antoniewski <christophe.antoniewski@snv.jussieu.fr>

Le 1 oct. 2012 à 10:49, Alban Lermine <alermine@curie.fr> a relayé :

 J'ai aussi configué galaxy de telle façon à ce qu'elle soit
servie sous apache + le module XSendFile.

Bonjour Ahmed,

Lors d'un récent upgrade d'ubuntu (notre OS), nous avons eu un soucis avec XSendFile.

Nous avons modifié le fichier de conf d'apache pour galaxy dans la section approprié, comme suit :

<Location "/galaxy">
    AuthType Basic
    AuthName "Galaxy Gate"
    AuthUserFile /etc/apache2/users
    require valid-user
    XSendFile on
    XSendFilePath /home/galaxy/galaxy-dist/
    # Compress all uncompressed content.
    SetOutputFilter DEFLATE
    SetEnvIfNoCase Request_URI \.(?:gif|jpe?g|png)$ no-gzip dont-vary
    SetEnvIfNoCase Request_URI \.(?:t?gz|zip|bz2)$ no-gzip dont-vary
#    XSendFileAllowAbove on #problem with 'precise' release of ubuntu
</Location>

Où j'ai laissé commenté la ligne qui causait le bug, et remplacé par XSendFilePath /home/galaxy/galaxy-dist/ , ou le path est le path absolu pour le code galaxy

Je ne suis pas certain que cela t'aide, mais en lisant en diagonale tes problèmes, ça me rappelait ce qu'on avait observé au moment de l'upgrade.

Chris


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Christophe Antoniewski

Drosophila Genetics and Epigenetics
Laboratoire de Biologie du Développement – UMR7622
CNRS – Université Pierre & Marie Curie
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