Bonjour,
J'ai eu également ce problème.
J'ai choisi de créer un seul fichier resultat au format HTML (donc dans le XML du tool il y a un seul fichier output)
et d'"embarquer" l'ensemble des fichiers soit sous forme d image ou de fichier à telecharger avec un encodage base64

exemple pour un fichier texte zippé :

echo '<a href="data:application/x-gzip;base64,'`gzip --stdout $current_file | base64 -w 0`'">'>> $html__
echo $comments_to_down >>$html__ 
echo '</a>' >> $html__

si tu ne zip pas le type mime est text/plain

ou pour une image :
<img  alt="description" src="data:image/png;base64,'''`base64 -w 0 $current_file_png`'"/>'

ne pas oublier d'effacer les fichiers generés par l'application après ce traitement

Olivier


Le 02/10/2012 17:05, Sarah Maman a écrit :
Bonjour,

Je souhaiterai intégrer un script perl (script quantifier de mirdeep2) dans un nouveau tool de mon instance locale de Galaxy.
Le problème est que ce script génère plusieurs outputs (fichiers images) mais le nombre d'outputs est variable d'une fois sur l'autre.
Il me semble que le nombre d'outputs doit être défini et fixe dans le fichier xml du tool ? Ou existe t'il un moyen pour que le nombre d'outputs ne soit pas précisé à l'avance ?

Merci d'avance pour votre aide,
Sarah Maman


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Hello,

I would like to integrate a perl script (script quantifier of mirdeep2) in a new tool in my local instance of Galaxy.
The problem is that this script generates several outputs (image files), but the number of outputs varies from one time to another.
It seems that the number of outputs must be defined and fixed in the tool xml file ? Or is there a way to not specify the number of outputs ?

Thank you in advance for your help,
Sarah Maman
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