Cloud computing pour la Biologie - Institut Français de Bioinformatique
Date: 6 novembre 2014, 9h30-17h30
L'Institut Français de Bioinformatique et la plate-forme GenOuest organisent une formation d'initiation à l‘utilisation du cloud computing pour l'analyse de données biologiques avec les outils usuels de bioinformatique.
Cette formation abordera les concepts et principes généraux du cloud, ainsi que la description des outils, des usages et de son intérêt pour la Bioinformatique. Une partie pratique sera effectuée par les participants sur les clouds concernés par la session (IFB-core ou Genocloud).
L'inscription est gratuite mais obligatoire en remplissant le formulaire à l'adresse suivante : http://registration.genouest.org/?ee=23
Le nombre de place est limité à 30. Si le nombre de participants venait à dépasser ce nombre, n'hésitez pas à nous écrire pour que nous puissions planifier une autre session.
Ce tutoriel est soutenu par l’Institut Français de Bioinformatique - IFB.
Cordialement,
Christophe Blanchet et Olivier Collin
Programme :
## Date: 6 novembre 2014, 9h30-17h30
Lieu: IRISA/INRIA - Campus de Beaulieu - Campus universitaire de Beaulieu - 263 Avenue du Général Leclerc - 35000 Rennes
Salle Markov
## Formateurs
Christophe BLANCHET (IFB-core)
Olivier COLLIN (GenOuest)
Charles LOOMIS (LAL)
Cyril MONJEAUD (GenOuest)
Olivier SALLOU (GenOuest)
## Programme
(chaque session comprendra une partie théorique et une mise en application sur les clouds académiques en production à IFB-core, GenOuest )
Pré-requis généraux : Venir avec un ordinateur avec un navigateur web récent.
9h00: Accueil
9h30: Cloud computing: principes généraux et exemple de StratusLab (C. Loomis)
Pré-requis : pour ceux qui le souhaiteront, il sera possible de pratiquer StratusLab à l'aide du client en commande ligne. Pour cela il faudra que vous ayez sur votre ordinateur le client StratusLab et les composants nécessaires [détails installation du client StratusLab], et un navigateur web récent. Une machine Linux ou Mac est préférée, mais une machine Windows est acceptable.
11h00: pause café
11h30: Cloud pour la biologie: exemples des clouds IFB-core (C. Blanchet, C.
Gauthey) et GenOuest (O. Sallou, C. Monjeaud).
13h00: repas
14h00: Exemples d’applications de cloud en NGS (Galaxy), protéomique et
analyse intensive de séquences avec Hadoop MapReduce
Pré-requis : installer le client X2Go [détails]
15h30: pause café
16h00: Perspectives et cas d’usage de la salle (Tous)
17h30: fin du tutoriel
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Olivier Collin - Plate-forme GenOuest
IRISA-INRIA, Campus de Beaulieu
35042 Rennes cedex, France
Tél: +33 (0) 2 99 84 72 78
Fax: +33 (0) 2 99 84 71 71
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