"Vous n'avez pas peur d'être en rade à cause d'un réservoir à sec, alors faites du RADseq via Stacks sous Galaxy!"

Bonjour à tous les Gars laxistes (pour reprendre le jeu de mot du Galaxy day 2013 ;) ),

Un petit mail pour véhiculer le fait que Cyril et moi avons mis à disposition de la communauté nos outils Galaxy permettant l'utilisation du pipeline STACKS via le Toolshed du Groupe GUGGO (http://toolshed.genouest.org/).

L'image Docker ylebras/stacks_galaxy est disponible sur le repository public officiel Docker à cet URL

Si vous êtes intéressés par le RADseq, nous avons créé un espace d'échange ouvert à tous à cet URL. Y sont notamment répertoriées des ressources d'intérêt.

Nous proposons une formation initiation à l'analyse de données RADseq sous Galaxy. Les souhaits d'inscription se font en se rendant à cette adresse. Les supports sont accessibles ici.

Le wiki GUGGO est toujours ouvert à tous à cet URL.

Vous y trouverez notamment le descriptif de nos premiers tests de l'utilisation de Docker sous Galaxy (https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/FirstGenOuest), ainsi qu'un rassemblement des liens d'intérêt concernant Docker et Galaxy (https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/PresenDocker). Beaucoup d'autres infos sur Galaxy dans le cloud, l'utilisation du tool shed, l'intégration d'outils dans Galaxy, .....

L'offre de formation des communautés GUGGO est accessible en se rendant à cet URL

N'hésitez pas à me contacter pour toute information supplémentaire.

Amicalement,

Yvan

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Yvan Le Bras, PhD <°))))><
e-Biogenouest project http://www.e-biogenouest.org
CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA, Campus de Beaulieu, 35042 Rennes Cedex
tél.: +33 (0) 2 99 84 72 78 / +33 (0) 6.10.43.96.51
yvan.le_bras@irisa.fr