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From: Patrick Nitschke <patrick.nitschke@parisdescartes.fr>
Date: 2014-04-28 13:48 GMT-07:00
Subject: [bioinfo] [Emploi][CDD] Ingenieur BioInformatique hopital Necker-Enfants malades
To: bioinfo@sfbi.fr


Le Pôle de Biologie et Produits de Santé de l’hôpital Universitaire
Necker-Enfants malades recherche  un bioinformaticien (niveau BAC+5 ou
école d’ingénieur) pour la mise en place d’outils diagnostiques
utilisant les techniques de séquençage à haut débit.

Missions :

• Mise en point et mise en place des workflows d’analyse
bioinformatique des données issues de séquenceurs NGS Illumina

• Mise au point et mise en place des algorithmes décisionnels et des
outils de validation des résultats

• Participation à la définition et à l’intégration des outils
développés dans le système d’information du laboratoire

• Participation aux études techniques et cliniques de validation

• Participation à la formation des utilisateurs finaux

Durée du CDD :

• 12 mois avec possibilité de transformation ultérieure en CDI

Compétences requises :

• Maîtrise des outils bioinformatiques du NGS

• Maîtrise du système UNIX, du SGBD MySQL et du langage de script PERL

• La connaissance d’un système de work-flow type Galaxy est un plus
pour cette mission

Environnement :

• Cette mission sera menée dans un environnement multidisciplinaire.
Outre les laboratoires du pôle de biologie, le bioinformaticien
travaillera en interaction étroite avec le service de biostatistique
et d’informatique médicale et la plate-forme bioinformatique
Paris-Descartes - Imagine.

Contacts :

• Pr Jean-Paul Bonnefont (jean-paul.bonnefont@nck.aphp.fr)


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