Boujour à tous, Je crois qu'on peut aussi penser à utiliser les "galaxy pages" pour écrire l'énoncé du workshop avec l'accès aux datasets, aux workflows, ... bref au ressources galaxy. L'utilisateur à la sortie du workshop peut donc tout rejouer en toute indépendance. ++ O. On Fri, 14 Sep 2012, Alban Lermine wrote: Bonjour à tous, > > Nous allons avoir à préparer différents workshops avec Galaxy dans les > mois à venir, et d'après ma très petite experience (1 workshop 40 > personnes), quelques limitations peuvent intervenir et géner la bonne > marche du workshop. > > En effet, la première limitation que j'ai pu identifier concerne les > accès serveurs (x personnes cliquant simultanément, ça fait quelques > embouteillages!). > Quoi faire? > > - Paramétrer son serveur en fonction du nombre de participants > (efficacité?) > - Changer de serveur web pour G-WAN (http://gwan.com/) qui permet > de gérer plus d'accès concurrents > - La solution qui me semble la plus indiquée est de passer par un > système de machines virtuelles (OS + Galaxy préinstallé et > préconfiguré), ce qui permet de s'affranchir completement des problèmes > serveurs (1 instance par participant) + la possibilité pour chaque > participant de repartir avec sa machine virtuelle Galaxy sous le bras et > réappliquer ce qu'il aura appris durant le workshop à la maison. > > Deuxième limitation, les temps de calcul. > > - Doit on laisser la possibilité aux participants d'analyser leurs > propres données (moins de contrôle sur les temps de calcul mais plus > interressant pour le participant) > - Préparer un set de données ciblées. Par ex, réduire un alignement > à la zone ou des variants sont clairement identifiés. Le but est > clairement didactique et moins interressant du point de vue des résultats. > - Précomputer tous les résultats et finalement n'effectuer aucun > calcul. Aucune charge serveur, mais impossible de faire varier les > paramètres (et donc difficile de montrer l'impact de ceux ci sur le > résultat). > > Bref, je pense que ça vaut le coup de bien préparer sa stratégie pour > un workshop réussit (ou les participants ne sont pas interrompu par un > serveur qui tombe ou des temps de calculs trop long). > > Pour compléter cette petite réflexion, un petit lien vers les notes > prises par Dave Clements lors d'un brainstorming qui a eut lieu en off > de la GCC2012 sur "comment bien organiser une formation avec Galaxy". > Lien: > http://wiki.g2.bx.psu.edu/**Events/GCC2012/Program/**Breakouts/** > BioinformaticsTraining<http://wiki.g2.bx.psu.edu/Events/GCC2012/Progra... > > Donnez moi votre avis et solutions envisagées, la compilation de toutes > vos reflexions aidera très certainement à la mise en place d'une > stratégie robuste. > > Bonne journée, > > Alban > > NB: petite anecdote entendue lors du brainstorming avec Dave Clements, > un labo situé en Inde a organisé un workshop pour 200 personnes sur le > site principal de Galaxy. Résultat des courses: le site est resté > offline pendant 48h! > > > -- > Alban Lermine > Unité 900 : Inserm - Mines ParisTech - Institut Curie > « Bioinformatics and Computational Systems Biology of Cancer » > 11-13 rue Pierre et Marie Curie (1er étage) - 75005 Paris - France > Tel : +33 (0) 1 56 24 69 84 > > ______________________________**_________________ > Galaxy-France mailing list > Galaxy-France(a)lists.bx.psu.edu > http://lists.bx.psu.edu/**listinfo/galaxy-france<http://lists.bx.psu.e... > _______________________________________________ Galaxy-France mailing list Galaxy-France(a)lists.bx.psu.edu http://lists.bx.psu.edu/listinfo/galaxy-france