Bonjour,
C'est un wrapper que tu écris toi même ou un wrapper du toolshed ?
Dans le permier cas, tu peux gérer ton upload avec un archive et dézippé
dans ton script.
Si ça t'intéresse, il te faudra utiliser le datatype joint pour dire à
Galaxy de ne pas dézippé les zip "multi-fichier"
Gildas
Le 14/04/2015 18:51, armougom a écrit :
Bonjour,
pour asembler du 16S paired end Miseq via Qiime sour Galaxy & il faut
passer un repertoire (contenant les fichiers R1 et R2)
au programme multiple_join_paired_ends.py de Qiime. Probleme je
n'arrive pas a uploader un repertoire. Comment faire??
j'ai essayer de creer une librairie, une collection mais rien n'y fait
ca n'est pas vu comme un repertoire par le programme, j'aicette erreur
systematiquement :
Error in multiple_join_paired_ends.py: option -i: not a directory
(can't be a file!): 'multiple_join_paired_ends_input'
Merci pour l'aide
Fabrice
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