Bonjour,

C'est un wrapper que tu écris toi même ou un wrapper du toolshed ?

Dans le permier cas, tu peux gérer ton upload avec un archive et dézippé dans ton script. Si ça t'intéresse, il te faudra utiliser le datatype joint pour dire à Galaxy de ne pas dézippé les zip "multi-fichier"

Gildas

Le 14/04/2015 18:51, armougom a écrit :

Bonjour,

pour asembler du 16S paired end Miseq via Qiime sour Galaxy & il faut passer un repertoire (contenant les fichiers R1 et R2) au programme multiple_join_paired_ends.py de Qiime. Probleme je n'arrive pas a uploader un repertoire. Comment faire?? j'ai essayer de creer une librairie, une collection mais rien n'y fait ca n'est pas vu comme un repertoire par le programme, j'aicette erreur systematiquement :

Error in multiple_join_paired_ends.py: option -i: not a directory (can't be a file!): 'multiple_join_paired_ends_input'

Merci pour l'aide Fabrice _______________________________________________ Galaxy-France mailing list Galaxy-France@lists.galaxyproject.org https://lists.galaxyproject.org/listinfo/galaxy-france

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