I am a new Galaxy user and I have searched the mail list, looking for the answers to my questions, but failed.

 

I am trying to fetch the corresponding codon or amino acid alignments among 46 species using genomic intervals in human.

 

I know if I have a list of human genomic intervals, I can get the nucleotide alignments of these intervals among 46 species. I have hundreds of genomic intervals in human. They are all located in CDS regions. I already fetched the alignment among the 46 species for each genomic interval. The thing is that I also want to know the corresponding codons or amino acids. Can somebody help me out? 

 

Thanks a million!

 

--------------------------------------------------------------------------------

 

Patricia Hsu

Kunming Institute of botany, CAS