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Dave C
---------- Forwarded message ---------- From: Christophe Blanchet christophe.blanchet@ibcp.fr Date: 2014-02-28 3:45 GMT-08:00 Subject: [bioinfo] Tutoriel << Utilisation du Cloud pour la Biologie >> To: Bioinfo bioinfo@sfbi.fr
Tutoriel << Utilisation du Cloud pour la Biologie >>
Les plateformes IDB-IBCP et GenOuest organisent une formation initiale à l 'utilisation du cloud computing pour des analyses de données biologiques avec les techniques usuelles en bioinformatique. Elle s'appuiera sur les deux clouds bioinformatiques actuellement opérationnels au niveau national: le cloud IDB à l'IBCP (Lyon, membre du PRABI) et le Génocloud à Genouest (Rennes, membre de IFB-GO). Ces deux infrastructures sont fonctionnelles depuis plusieurs années et proposent des services d'analyse à leur communauté propre d'utilisateurs. Ces clouds ont été choisis comme pilotes par l'institut Français de Bioinformatique (CNRS UMS3601) pour la préparation de son infrastructure de cloud académique. L'objectif est de former les utilisateurs, biologistes et bioinformaticiens, à l'utilisation du cloud IDB et GenoCloud comme précurseurs du futur cloud IFB. Le programme de la formation contiendra les concepts et principes généraux du cloud, ainsi que la description des outils, usages et avantages actuels pour la Bioinformatique. Une partie pratique sera effectuée par les participants sur le cloud concerné par la session (IDB ou Génocloud).
L'inscription est gratuite mais obligatoire, par mail auprès des organisateurs. Le nombre de places étant limitées, les inscriptions se feront dans l'ordre d'arrivée.
Ce tutoriel est soutenu par l'Institut Français de Bioinformatique - IFB.
IDB-IBCP: http://idee-b.ibcp.fr GenOuest: http://www.genouest.org
## Date: 18 mars 2014, 9h-17h30 Lieu: Institut de Biologie et Chimie des Protéines, CNRS-IBCP, 7 passage du Vercors, Lyon, France
## Formateurs Christophe BLANCHET (IDB-IBCP) Olivier COLLIN (GenOuest) Clément GAUTHEY (IDB-IBCP) Charles LOOMIS (LAL) Cyril MONJEAUD (GenOuest) Olivier SALLOU (GenOuest)
## Programme (chaque session comprendra une partie théorique et une mise en application sur les clouds académiques en production à IDB-IBCP, GenOuest et P2IO)
9h00: Accueil
9h30: Cloud computing: principes généraux et exemple de StratusLab (C. Loomis)
11h00: pause café
11h30: Cloud pour la biologie: exemples des clouds IDB-IBCP (C. Blanchet, C. Gauthey) et GenOuest (O. Sallou, C. Monjeaud).
13h00: repas
14h00: Exemples d'applications de cloud en NGS (Galaxy), protéomique et analyse de séquences intensive avec Hadoop MapReduce
15h30: pause café
16h00: Perspectives et cas d'usage de la salle (Tous)
17h30: fin du tutoriel
## Bulletin d'inscription à envoyer à : Christophe Blanchet christophe.blanchet@ibcp.fr, Olivier Collin olivier.collin@irisa.fr
Souhaite participer au Tutoriel << Utilisation du Cloud pour la Biologie >> le 18 mars 2014 à l'IBCP.
Civilité (Mme, M., Pr., Dr): NOM: Prénom: Email: Tél.: Statut (chercheur, ens.-cherch., thésard, postdoc, etc.) : Organisme : Fonction: Laboratoire (Nom et Sigle) : Adresse postale:
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