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Dave C
---------- Forwarded message ---------- From: Nicolas Servant nservant@curie.fr Date: 2013/3/14 Subject: [bioinfo] CDD Ingénieur en Bioinformatique grand séquençage - Institut Curie To: bioinfo@sfbi.fr
Bonjour,
Un poste d'Ingénieur en Bioinformatique pour l'analyse des données à haut-débit est ouvert au Centre de Recherche de l'Institut Curie à Paris ( http://www.curie.fr). Le candidat travaillera au sein de la plate-forme bioinformatique de l'unité U900 de Bioinformatique et Biologie des Systèmes du Cancer (U900 INSERM - Mines ParisTech - Institut Curie, http://u900.curie.fr ).
Contexte : L'Institut Curie est un acteur majeur dans le traitement et la recherche contre le Cancer. Composé à la fois d’un Hôpital et d’un Centre de Recherche, l'expertise de l'Institut Curie s'étend de la recherche fondamentale au soin du patient. L’objectif du Centre de Recherche de l’Institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le pronostic, le traitement des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade. L'unité U900 compte près de 80 ingénieurs, chercheurs et étudiants en bioinformatique, biostatistiques et biologie des systèmes (mathématiciens, statisticiens, bioinformaticiens, informaticiens, biologistes, physiciens, médecins et bioanalystes).
Mission : Au sein de la plate-forme bioinformatique et dans le cadre de l'initiative France Génomique, l’Ingénieur en Bioinformatique participera : - à l'implémentation et à la mise en place des chaînes de traitements de données NGS issues de différentes technologies de séquençage (Illumina, IonTorrent et SOLiD), - à la mise en place des tests, à la validation et à la maintenance des solutions d'analyses bioinformatiques. - à la mise à disposition des solutions d’analyses aux utilisateurs via l'environnement Galaxy.
L’Ingénieur en Bioinformatique interviendra dans des projets de recherche fondamentale et/ou translationnelle (smallRNA-seq, ChIP-seq) ainsi que dans des approches d'analyses cliniques (re-séquencage ciblé de gènes).
Profil recherché : Titulaire d’un diplôme d'ingénieur ou d’un master en bioinformatique, vous disposez des compétences suivantes : - Connaissance des principaux logiciels et méthodes de bio-informatique, en particulier ceux utilisés en génomique et pour les analyses de données NGS. - Maîtrise de l'environnement linux/unix et des outils de développement collaboratifs (SVN, etc.) - Maîtrise des langages Perl et Python. La connaissance du langage C, C++ ou R serait un plus. - Connaissances sur les bases de données (MySQL, SQL) et les technologies web - Aisance dans un environnement multidisciplinaire, goût du travail en équipe, sens du relationnel. - Curiosité scientifique, rigueur méthodologique - Avoir un bon niveau d'anglais écrit et oral.
Une connaissance des approches NGS appliquées aux recherches de variants (SNPs, indels) et de l’outil Galaxy seront des atouts importants.
Lieu de travail : Paris (5e) Rémunération : Selon profil et expérience
Adresser vos candidatures (CV, motivation et références par courrier électronique à : bcsb61@curie.fr
Bien Cordialement Nicolas Servant