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Dave C
---------- Forwarded message ---------- From: Nicolas Servant nservant@curie.fr Date: 2014-09-29 1:32 GMT-07:00 Subject: [bioinfo] CDD Ingénieur NGS - Institut Curie To: bioinfo@sfbi.fr
Bonjour,
Un poste d'ingénieur en Bioinformatique pour l'analyse des données à haut-débit est ouvert au Centre de Recherche de l'Institut Curie ( http://www.curie.fr) à Paris. Le candidat travaillera au sein de la plate-forme bioinformatique de l'unité U900 « Cancer et génome : bioinformatique, biostatistiques et épidémiologie d'un système » (U900 INSERM - Mines ParisTech - Institut Curie, http://u900.curie.fr).
Contexte : L'Institut Curie est un acteur majeur dans le traitement et la recherche contre le Cancer. Composé à la fois d’un Hôpital et d’un Centre de Recherche, l'expertise de l'Institut Curie s'étend de la recherche fondamentale au soin du patient. L’objectif du Centre de Recherche de l’Institut Curie est de développer la recherche fondamentale et d’utiliser ces connaissances pour améliorer le diagnostic, le pronostic, le traitement des cancers dans le cadre du continuum entre la recherche fondamentale et l’innovation au service du malade. L'unité U900 compte près de 80 ingénieurs, chercheurs et étudiants en bioinformatique, biostatistiques et biologie des systèmes (mathématiciens, statisticiens, bioinformaticiens, informaticiens, biologistes, physiciens, médecins et bioanalystes).
Mission : Dans le cadre du projet France Génomique, les plates-formes de bioinformatique sont chargées de mettre à la disposition des utilisateurs une collection de ressources dédiées à l'analyse de données NGS. L'ingénieur recruté sera responsable de l'évaluation et de l'implémentation des méthodes bioinformatiques permettant l’analyse de données NGS, notamment smallRNA-seq, ChIP-seq et methyl-seq. Au sein de la plate-forme bioinformatique U900, l’Ingénieur en bioinformatique participera : - à la définition des stratégies d'analyse des données de grand séquençage, - à l'implémentation et à la mise en place des chaînes de traitement d'analyses, - à la maintenance des pipelines et outils d’analyse existant, - à la valorisation et au partage des applications développées dans la communauté scientifique (packages distribués, et services en ligne) - aux analyses tertiaires des données en collaboration avec les différentes équipes utilisatrices de la plate-forme
Profil recherché : Titulaire d’un diplôme d'ingénieur ou d’un master en bioinformatique, vous disposez des compétences suivantes : - Fort intérêt pour le domaine des sciences biologiques et/ou médicales. - Maîtrise des concepts et outils bioinformatiques appliqués à l’analyse de données NGS. - Maîtrise de l'environnement linux/unix. - Bonne connaissance d’un langage de script (Perl et/ou Python), et R (des connaissances en langage C, C++ seraient un plus). - Avoir un bon niveau d'anglais écrit et oral. - Avoir un bon sens relationnel, organisé, et consciencieux Une première expérience en analyse de données NGS ainsi qu’une connaissance de l’environnement Galaxy, seront appréciées.
Lieu de travail : Paris (5 ) Rémunération : Selon profil et expérience
Adresser vos candidatures (CV, motivation et références par courrier électronique à bcsb73@curie.fr Cordialement,