Hello all, Forwarding from SFBI list. Dave C ---------- Forwarded message ---------- From: Audrey Bihouée <audrey.bihouee@univ-nantes.fr> Date: 2013/11/8 Subject: [bioinfo] Journée d'animation de ReNaBi GrandOuest, le 29 novembre à Rennes - Focus sur les workflows To: bioinfo@sfbi.fr * Comme chaque année la plate-forme ReNaBI-Grand Ouest organise une journée de rencontres autour d’un thème lié à la bio-informatique. Cette année, pour la 11ème édition de ces rencontres, la journée sera consacrée aux workflows en bio-informatique.* *Elle aura lieu vendredi 29 novembre sur le campus de Beaulieu (Amphithéâtre de l'INRIA/IRISA), l’inscription est gratuite mais obligatoire**. * Inscriptions : http://registration.genouest.org/?ee=13 < http://registration.genouest.org/?ee=13> *_ Programme prévisionnel_* : 09h30-10h15 Accueil des participants /Matinée/ - 10H15-11h00 : Workflows et parallélisation (François Moreews - INRA) - 11H-11h45 : Actualité Galaxy (Galaxy-IFB, GUGGO, Instances dans le GO) - 11H45-12h30 : Présentation des formations en bioinformatique en Bretagne et Pays de Loire (Christian Delamarche - Université de Rennes, Bernard Offman - Université de Nantes) 12H30-14h00 : /Déjeuner/ /Après-midi/ - 14H00-14h30 : Construction de workflows à partir de ressources annotées sémantiquement - Mobyle 2 ( Hervé Ménager - Institut Pasteur) - 14H30-15h00 : "Mon Make à moi": parallelisation, workflows et pipelines pour le NGS , tout sauf Galaxy. (Pierre Lindenbaum) - 15H00-15h30 : - 16h00-16h30 : Exemple de workflow en biologie marine (S. Goulitquer - Station Biologique de Roscoff) - "Metabomer: avant/après Galaxy" - 15H30-16h00 : Pause - 16h00-16h30 : Médecine personnalisée, Test compagnon et Recherche de Mutations Cibles (Birama N'Diaye - Génétique Moléculaire et Génomique - CHU Pontchaillou) - 16h30-17h00 : Clôture ------------------------------------------------------------------------ *Audrey Bihouee* /Plateforme Bioinformatique de Nantes - BIRD <http://cardioserve.nantes.inserm.fr/BIRD/>/ IRS UN l'institut du thorax, Inserm UMR 1087 / CNRS UMR 6291 8 Quai Moncousu BP 70721 44007 Nantes cedex 1 Tel : 33 (0)2 28 08 00 55 Fax : 33 (0)2 28 08 00 49 www.umr1087.univ-nantes.fr <http://www.umr1087.univ-nantes.fr> -- http://www.sfbi.fr Archives : http://listes.sfbi.fr/wws/arc/bioinfo -- http://galaxyproject.org/ http://getgalaxy.org/ http://usegalaxy.org/ http://wiki.galaxyproject.org/