24 Apr
2018
24 Apr
'18
1:55 p.m.
Dear all,
We found something strange with our Galaxy instance...
Our Galaxy server is configured as a submit node using slurm to submit to our cluster.
This works fine for the most part, but today we saw a samtools index job running "locally" on the submit node instead of a cluster node.
Is there any way of stopping this behavior? The submit nodes are not configured for data-intensive computation and everything runs significantly slower.
I was running bamtools (splitting a bam-file into mapped into unmapped) at the time and the output bam-files were being indexed.
Thanks and best regards,
Christopher
--
*Dr. Christopher Previti*
Genomics and Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician
German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg
Germany
Room: B2.102 (INF580/TP3)
Phone: +49 6221 42-4661
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