12 Nov
2018
12 Nov
'18
10:49 a.m.
Dear all,
I've been wanting to point this out for a while, but the latest update to the STAR data manager didn't fix it either (or maybe I messed up again). The .loc file indicating which genomes have been installed/indices have been made for STAR uses the last column to indicate if there is a gene model/annotation that it should use (0 - for no, 1 - for yes). This seems to be empty...there is a tab at the end of the row, but no number. It works if you manually but in 1 or 0, but not that's not very convenient.
Please let me know if I'm missing something...
Cheers, Christopher
--
*Dr. Christopher Previti*
Genomics and Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician
German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg
Germany
Room: B2.102 (INF580/TP3)
Phone: +49 6221 42-4661
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www.dkfz.de http://www.dkfz.de/
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