Dear all,
I've been wanting to point this out for a while, but the latest update
to the STAR data manager didn't fix it either (or maybe I messed up again).
The .loc file indicating which genomes have been installed/indices have
been made for STAR uses the last column to indicate if there
is a gene model/annotation that it should use (0 - for no, 1 - for yes).
This seems to be empty...there is a tab at the end of the row, but no
number.
It works if you manually but in 1 or 0, but not that's not very convenient.
Please let me know if I'm missing something...
Cheers,
Christopher
--
*Dr. Christopher Previti*
Genomics and Proteomics Core Facility
High Throughput Sequencing (W190)
Bioinformatician
German Cancer Research Center (DKFZ)
Foundation under Public Law
Im Neuenheimer Feld 580
69120 Heidelberg
Germany
Room: B2.102 (INF580/TP3)
Phone: +49 6221 42-4661
christopher.previti@dkfz.de
http://www.dkfz.de/
www.dkfz.de
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Management Board: Prof. Dr. Michael Baumann, Prof. Dr. Josef Puchta
VAT-ID No.: DE143293537
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