Goodday,
I am experimenting with the Galaxy tool and adding a module itself is no problem.
Furthermore there are a lot of datatypes supported (FASTA etc.), but it seems NetCDF is
not yet 'supported'. So I found out that you can add your own datatype (
http://bitbucket.org/galaxy/galaxy-central/wiki/AddingDatatypes ), but before doing that,
I was wondering how to support reading the NetCDF datatype - especially for mass
spectrometry data?
Or is there another datatype which I can use to read mass spectrometry NetCDF's in
Galaxy?
Thanks in advance and with kind regards,
Tjeerd Abma
Scientific programmer/Bioinformatician
UMCU Metabolomics Centre
Dept. Metabolic and Endocrine Diseases
Wilhelmina Childrens Hospital, UMC Utrecht
T: 088-7554330
E: t.w.abma(a)umcutrecht.nl
http://www.metabolomics-utrecht.nl
------------------------------------------------------------------------------
De informatie opgenomen in dit bericht kan vertrouwelijk zijn en is
uitsluitend bestemd voor de geadresseerde. Indien u dit bericht onterecht
ontvangt, wordt u verzocht de inhoud niet te gebruiken en de afzender direct
te informeren door het bericht te retourneren. Het Universitair Medisch
Centrum Utrecht is een publiekrechtelijke rechtspersoon in de zin van de W.H.W.
(Wet Hoger Onderwijs en Wetenschappelijk Onderzoek) en staat geregistreerd bij
de Kamer van Koophandel voor Midden-Nederland onder nr. 30244197.
Denk s.v.p aan het milieu voor u deze e-mail afdrukt.
------------------------------------------------------------------------------
This message may contain confidential information and is intended exclusively
for the addressee. If you receive this message unintentionally, please do not
use the contents but notify the sender immediately by return e-mail. University
Medical Center Utrecht is a legal person by public law and is registered at
the Chamber of Commerce for Midden-Nederland under no. 30244197.
Please consider the environment before printing this e-mail.