Salut Ahmed,
Je reposte ton message avec un nouvel intitulé (tu avais posté en réponse au mail de présentation de la liste):
Bonjour à tous, J'ai installé une instance galaxy qui tourne sous linux fedora 17 x86_64. Je l'ai configuré pour qu'elle utilise MySQL à la place de la base de donnée par défaut. J'utilise aussi un cluster local sous PBS/Torque. J'ai aussi configué galaxy de telle façon à ce qu'elle soit servie sous apache + le module XSendFile. Cela tourne sans problème du moins pour uploader les fichier et lancer les jobs. il n'y a aucune erreur pour le lancerment des jobs et les fichiers résultats sont accessibles dans la path files/000/data... Cependant je n'arrive pas à télécharger les fichers visibles sous l'historique de galaxy, j'obtiens toujours des fichiers 0 bytes. Aussi le preview est possible mais pas le full display. Sachant que j'ai activé le module XSendFile à la fois dans httpd.conf et dans universe.ini .
J'ai cherché dans les différents log le seul hic que je vois c'est un conflit, le suivant: galaxy-dist/lib/galaxy/__init__.py:79: UserWarning: Module markupsafe was already imported from /usr/lib64/python2.7/site-packages/markupsafe/__init__.pyc, but galaxy-dist/eggs/MarkupSafe-0.12-py2.7-linux-x86_64-ucs4.egg is being added to sys.path self.check_version_conflict()
quelqu'un a une idée de la source de ce problème?
Merci d'avance
Ahmed Essagir