"Vous n'avez pas peur d'être en rade à cause d'un réservoir à sec, alors faites du RADseq via Stacks sous Galaxy!"
Bonjour à tous les Gars laxistes (pour reprendre le jeu de mot du Galaxy day 2013 ;) ),
Un petit mail pour véhiculer le fait que Cyril et moi avons mis à disposition de la communauté nos outils Galaxy permettant l'utilisation du pipeline STACKS via le Toolshed du Groupe GUGGO ( http://toolshed.genouest.org/ ).
L'image Docker ylebras/stacks_galaxy est disponible sur le repository public officiel Docker à cet URL
Si vous êtes intéressés par le RADseq, nous avons créé un espace d'échange ouvert à tous à cet URL . Y sont notamment répertoriées des ressources d'intérêt.
Nous proposons une formation initiation à l'analyse de données RADseq sous Galaxy. Les souhaits d'inscription se font en se rendant à cette adresse . Les supports sont accessibles ici .
Le wiki GUGGO est toujours ouvert à tous à cet URL .
Vous y trouverez notamment le descriptif de nos premiers tests de l'utilisation de Docker sous Galaxy ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/FirstGenOuest ), ainsi qu'un rassemblement des liens d'intérêt concernant Docker et Galaxy ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/PresenDocker ). Beaucoup d'autres infos sur Galaxy dans le cloud, l'utilisation du tool shed, l'intégration d'outils dans Galaxy, .....
L'offre de formation des communautés GUGGO est accessible en se rendant à cet URL
N'hésitez pas à me contacter pour toute information supplémentaire.
Amicalement,
Yvan