Aïe, sans les hyperliens, ça fait mal aux ouïes... La version explicite ci-dessous ;) Amicalement, Yvan "Vous n'avez pas peur d'être en rade à cause d'un réservoir à sec, alors faites du RADseq via Stacks sous Galaxy!" Bonjour à tous les Gars laxistes (pour reprendre le jeu de mot du Galaxy day 2013 ), Un petit mail pour véhiculer le fait que Cyril et moi avons mis à disposition de la communauté nos outils Galaxy permettant l'utilisation du pipeline STACKS ( http://creskolab.uoregon.edu/stacks/ ) via le Toolshed du Groupe GUGGO ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo, http://toolshed.genouest.org/ ). L'image Docker ylebras/stacks_galaxy est disponible sur le repository public officiel Docker à cet URL ( https://registry.hub.docker.com/u/ylebras/stacks_galaxy/ ) Si vous êtes intéressés par le RADseq, nous avons créé un espace d'échange ouvert à tous à l' URL https://www.e-biogenouest.org/groups/radseq . Y sont notamment répertoriées des ressources d'intérêt. Nous proposons une formation initiation à l'analyse de données RADseq sous Galaxy. Les souhaits d'inscription se font en se rendant à cette adresse ( http://registration.genouest.org/ ) . Les supports sont accessibles ici ( https://www.e-biogenouest.org/resources/1287/supportingdocs ) . Le wiki GUGGO est toujours ouvert à tous à cet URL ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki ) . Vous y trouverez notamment le descriptif de nos premiers tests de l'utilisation de Docker sous Galaxy ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/FirstGenOuest ), ainsi qu'un rassemblement des liens d'intérêt concernant Docker et Galaxy ( https://www.e-biogenouest.org/groups/guggo/wiki/PresenDocker ). Beaucoup d'autres infos sur Galaxy dans le cloud, l'utilisation du tool shed, l'intégration d'outils dans Galaxy, ..... L'offre de formation des communautés GUGGO est accessible en se rendant à l'adresse https://www.e-biogenouest.org/einfrastructure/education N'hésitez pas à me contacter pour toute information supplémentaire. Amicalement, Yvan -- ------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------- Yvan Le Bras, PhD <°))))>< e-Biogenouest project http://www.e-biogenouest.org CNRS UMR 6074 IRISA-INRIA, Campus de Beaulieu, 35042 Rennes Cedex tél.: +33 (0) 2 99 84 72 78 / +33 (0) 6.10.43.96.51 yvan.le_bras(a)irisa.fr